จากน้ำพระราชหฤทัยที่ทรงห่วงใยในทรัพยากรธรรมชาติทางทะเลของไทยที่ลดน้อยลง และสัตว์ทะเลหลายชนิดที่ตกอยู่ในสถานะใกล้สูญพันธุ์ โดยเฉพาะ "เต่าทะเล" (เช่น เต่ามะเฟือง เต่าตนุ เต่ากระ) ซึ่งในอดีตถูกคุกคามอย่างหนักจากการลักลอบเก็บไข่เต่าไปบริโภคและจำหน่าย
พระองค์จึงมีพระราชดำริให้ดำเนินโครงการอนุรักษ์เต่าทะเล โดยได้พระราชทานพื้นที่บน เกาะมันใน จังหวัดระยอง จัดตั้งเป็นศูนย์อนุรักษ์ฯ และพระราชทานชื่อว่า "โครงการสมเด็จ ฯ อนุรักษ์พันธุ์เต่าทะเล" ตั้งแต่วันที่ ๑๑ สิงหาคม พ.ศ. ๒๕๒๒
เพื่อน้อมนำและสืบสานพระราชปณิธานดังกล่าว กองทัพเรือ ซึ่งได้ดำเนินงานคุ้มครองพื้นที่วางไข่เต่าทะเลที่สำคัญอย่าง เกาะคราม และเกาะใกล้เคียงในพื้นที่สัตหีบมาอย่างต่อเนื่อง จึงได้จัดตั้ง "ศูนย์อนุรักษ์เต่าทะเล กองทัพเรือ" ขึ้นในปี พ.ศ. ๒๕๓๗
เพื่อน้อมรำลึกในพระมหากรุณาธิคุณ ปัจจุบัน ศูนย์อนุรักษ์เต่าทะเล กองทัพเรือ (ในความรับผิดชอบของ ฝ่ายกิจการพลเรือน หน่วยบัญชาการต่อสู้อากาศยานและรักษาฝั่ง) ยังคงดำเนินงานตามพระราชดำริอย่างแข็งขัน ทั้งการเฝ้าระวังการวางไข่ การเพาะฟักไข่เต่า การอนุบาลลูกเต่าให้แข็งแรงก่อนปล่อยคืนสู่ธรรมชาติ และยังเป็นศูนย์กลางการเรียนรู้ เพื่อปลูกฝังจิตสำนึกในการอนุรักษ์ทรัพยากรทางทะเลให้แก่ประชาชนสืบไป